野生動物や動物園・水族館など飼育下の動物を対象とした、動物の生態・行動・社会・保全などの研究について解説する。一連の講義を通じて、野生動物の研究を概観する。また、動物の生態学、社会学、保全生物学などの研究領域の基本的な考え方を学ぶ。

動物生態学、動物社会学、保全生物学などの基礎的な考え方を理解する。また、そのような考え方から、環境問題や人間の行動といった身近な現象を捉えなおし、さまざまな視点から物事を考察するための基礎知識を習得する。

以下の主題に関して、野生動物研究センターの教員がリレー形式で概説する。詳細な講義日程、各回の講義内容などについては、初回の講義においてアナウンスする。

１）野生動物を遺伝子解析によって理解する（5回）佐藤
　直接観察が難しい野生動物でも、DNAを調べることで生態や進化に関する情報が得られる。遺伝解析による種や性の判別、個体差の検出、個体数の推定、等について、例をあげて説明する。また遺伝情報にもとづく野生動物の保全や生態研究の様々な可能性について解説する。
２）野生動物の認知・行動・社会（4回）山本
　動物たちは、何を考え、どのように振る舞い、どんな社会を築いているのだろうか？多様な動物種の心・行動・社会に迫る比較研究について概説する。このような研究と保全や動物福祉、さらには人間理解へのつながりについても紹介する。
３）野生動物の生態・保全（5回）豊田　
　 野生動物の生態についての基礎的な知識や野外調査における研究手法について、霊長類を中心に陸生哺乳類の例を紹介しながら解説する。また、野生動物の保全において問題となる人と野生動物との間に生じる軋轢についても解説し、人と動物の共存のために必要な取り組みについて、国内外の事例を紹介する。
４）期末試験
５）フィードバック（1回）

高校等での生物の履修経験は必要としない。授業中必要になる知識については、授業内で適宜補足する。

期末試験（筆記）による絶対評価

予習は特に必要ない。授業で、特に重要な概念・用語などを指摘するので、それらを復習することで、基礎的な知識を身につけてほしい。

　わが国の自然環境は、森林生態系・里域生態系・沿岸生態系から構成され、これらは河川などを通じて相互に連環しています。特に、森林と海の間に位置する里域では、人間活動の影響が強く現れ、自然と人間社会の関係性が複雑に絡み合っています。
　これまでフィールド研究は、森・里・湖・海といった個別のユニットごとに行われてきました。しかし近年、人間活動のインパクトがこれらの境界を越えて広がり、生態系間の物質循環や相互作用、生物の多様性などに大きな影響を与えています。今後の持続可能な社会の実現には、複合的な自然生態系と人間社会の共存システムを総合的に理解することが不可欠です。
　本講義では、森林から海へとつながる生態系と人間活動の関係について講義とフィールドワークを通じて学び、地球環境を「連環」という視点から捉えます。さらに、「森里海連環学」という新しい学問領域を体系的に理解し、少人数演習におけるフィールドワークを通じて、実践的にその意義と方法論を学ぶことを目的とします。

○統合型複合科目分類【理・理】
主たる課題について理系分野の要素が強く、副たる課題についても理系分野の要素が強いと考えられるもの

・森林生態系、里域生態系、沿岸生態系の特徴を学び、それぞれの生態学的プロセスと人間活動の影響を理解する。
・生態系間の連環（物質循環・生物相互作用）の仕組みを科学的データや事例をもとに理解し、説明できるようになる。
・地域社会における環境利用や保全の現状を踏まえ、持続可能な自然共生のあり方を統合的に考察できるようになる。
・フィールドワークを通じて環境データの観察・記録・分析・議論の方法を習得する。

（この授業では、講義と少人数演習を併せて学びます。講義のみ、少人数演習のみの出席では授業の到達目標に達しません。なお、講義の第1回から第5回に少人数演習の概要説明が含まれます）

◆講義　金曜4限（共東32）
第1回　ガイダンス/フィールドワーク概論/演習Ｂ：森は海の恋人/演習Ａ：森里海連環学実習I：芦生研究林—由良川—丹後海のつながりを探る/演習Ｅ：森を育て活かす−林業体験をとおして考える/演習Ｈ：安全安心な水循環系—健康関連微生物の調査を通して考える（下村、鈴木啓、長谷川、西村）
第2回　森林と地球環境問題/演習Ｄ：自然体験の感動を科学する（伊勢）
第3回　森林の多様性/演習Ｃ：森里海連環学実習II ：北海道東部の森と里と海のつながり（小林）
第4回　陸域モニタリング/演習Ｆ：京都の文化を支える森林−地域の智恵と生態学的知見（石原）
第5回　陸域の物質循環/演習Ｇ：里山の物質循環—燃料・肥料・食料から考える—（舘野）
第6回　森里海連環学とは/フィールドワークの安全管理（徳地）
第7回　沿岸域の利用（鈴木啓）
第8回　流域の環境質管理（西村）
第9回　沿岸域の多様性とモニタリング（中野）
第10回　森林の利用（長谷川）
第11回　沿岸域生態系とその利用（益田）
第12回　生物の行動調査とモニタリング（三田村）
第13回　森林資源の利用と川・湖・海の役割（坂野上）
第14回　森・里・湖・海と人のつながりとコミュニティー（田中）
第15回　フィードバック（学生発表会：全演習終了後の夏休み期間中にオンラインで実施）


◆少人数演習（概要）
（詳細は後述：PCの方は [Ctrl + F] キー、スマホの方はブラウザメニューの『ページ内検索』で、班名を入れると一瞬で移動できます）

　少人数演習は以下の8つの班に分かれて実施する。班ごとに若干内容は異なるが、概ね、テーマに関連した講義、フィールドワーク、作業体験、見学、ラボワーク（種同定、分析等）、データ解析、発表の流れで行われる。
　詳細は、講義の少人数演習概要で説明するとともに、LMSに掲載する。どの演習に参加したいかのアンケート調査を複数回実施して人数調整する。参加者が集中した場合は、人数調整を行うため、必ずしも希望する少人数演習に参加できない場合がある。アンケートには必ず第1希望から第3希望まで記入すること。第2希望と第3希望を書いていない場合は第1希望で抽選が外れた場合は教員側で他の演習に割り振る。
　どの演習に参加したいかのアンケート調査を複数回実施して人数調整する。参加者が集中した場合は、人数調整を行うため、必ずしも希望する少人数演習に参加できない場合がある。

【Ａ班】森里海連環学実習I：芦生研究林—由良川—丹後海のつながりを探る
キーワード：森里海連環学 / 由良川/ 水質 / 水生昆虫 / 魚類
時期：2026年8月6日〜10日（4泊5日）
実施場所：京大フィールド研　芦生研究林（京都府南丹市）、舞鶴水産実験所（京都府舞鶴市）
定員：8名
費用：宿泊費3600円，交通費約4200円，食費実費
担当教員：鈴木啓太，中西麻美，甲斐嘉晃，益田玲爾，石原正恵，松岡俊将，鈴木華実
その他：特になし

【Ｂ班】森は海の恋人
キーワード：森里海連環学 / 漁業 / 植樹 / 東日本大震災
時期：2026年8月下旬（3泊4日）
実施場所：宮城県気仙沼市舞根森里海研究所
定員：6名
費用：宿泊費3万円程度（別途、気仙沼までの交通費と食費がかかります）
担当教員：下村通誉、中野智之、河村真理子、後藤龍太郎、山守瑠奈
その他：実習日までに畠山重篤氏著作の書籍を1冊読んでおいてください

【Ｃ班】森里海連環学実習II ：北海道東部の森と里と海のつながり
キーワード：森里海連環学 / 森林 / 河川 / 沿岸海域 / 人間活動
時期：2026年9月6日〜12日(6泊7日)
実施場所：北海道標茶町（京都大学北海道研究林）および厚岸町（北海道大学厚岸臨海実験所）
定員：10名
費用：食費・宿泊費等1.4万円程度（別途、標茶までの交通費がかかります）
担当教員：小林和也・中山耕至・杉山賢子
その他：特になし

【Ｄ班】自然体験の感動を科学する
キーワード：環境 / 生態学 / 心理学 / エコツーリズム
時期：2026年9月下旬（2泊3日）
実施場所：京都大学紀伊大島実験所（和歌山県串本町）
定員：7名
費用：宿泊費および食費1万円程度（別途、串本町までの交通費がかかります）
担当教員：伊勢武史
その他：吉田キャンパスで開催する事前説明会に参加してください

【Ｅ班】森を育て活かす−林業体験をとおして考える
キーワード：森里海連環学 / 林業 / 森林資源利用/ 山村 / 木文化
時期：2026年8月下旬（3泊4日）
実施場所：和歌山県有田郡有田川町ほか（変更の可能性あり）
定員：5名
費用：宿泊費・食費等　3万円程度（現地での交通費は掛かりません）
担当教員：長谷川尚史
その他：自分の日常生活の中で，木材をはじめとする森林資源がどのように人間社会で活用されているかを観察しておいて下さい

【Ｆ班】京都の文化を支える森林−地域の智恵と生態学的知見
キーワード：森林 / 生態系サービス / 林業 / 野生動物 / 里山
時期：2026年9月9-11日（2泊3日）
実施場所：上賀茂試験地、芦生研究林、北白川試験地
定員：13名
費用：宿泊費・食費　5000円程度（別途、上賀茂試験地までの交通費がかかります）
担当教員：石原正恵、坂野上なお
その他：吉田キャンパスで開催する事前説明会に参加してください

【Ｇ班】里山の物質循環—燃料・肥料・食料から考える—
キーワード：里山 / 物質循環 / 生態学 / 持続可能性 / 森林科学
時期：2026年7月中旬から9月上旬で3日間（日帰り）
実施場所：上賀茂試験地（京都市北区）
定員：12名
費用：交通費（叡電往復700円程度、自転車だと０円）、昼食代等の実費
担当教員：舘野隆之輔
その他：特になし

【Ｈ班】安全安心な水循環系—健康関連微生物の調査を通して考える
キーワード：流域圏 / 水循環 / 健康関連微生物 / 上水 / 下水 / 薬剤耐性 / リスク評価
時期：2026年8月18-21日（日帰り）
実施場所：附属流域圏総合環境質研究センター、琵琶湖流域における下水処理施設および河川
定員： 3人
費用：主にセンターまでの交通費および昼食費用
担当教員：宇楊再治、伊藤禎彦、西村文武、松田知成、浅田安廣、林東範
その他：水質調査には4日（内、予備日1日）を予定しておいてください


◆少人数演習（詳細説明）

【Ａ班】森里海連環学実習I：芦生研究林—由良川—丹後海のつながりを探る
［演習の概要・目的］
　我が国は海に囲まれた森の国である。森林に降った雨は里域で田畑をうるおし、人間活動に伴う様々な負荷を受けたのちに、河川に流入して沿岸域へ流れ込む。そのため、陸上生態系のあらゆる変化が河川を通して集積され、最終的には沿岸海洋域の生態系に影響を与える。本実習では、由良川を実習フィールドとして、芦生研究林内の源流域から河口までの環境と生態を調査し、森や市街などの陸域の構造や人間による利用が、河川の水質、動植物の組成や生態にどのように影響しているかを調べる。森林域では森林構造を観察し、里域では流域の利用実態を調べ、河川〜河口域では環境観測と水質（栄養塩）分析、魚類、水生昆虫、エビ・カニ類、プランクトン・付着藻類などの生物採集を行う。採集した動植物の種類を同定し、魚類の消化管内容物を分析する。これらの調査結果を総合して、森林域から河川を通して河口域へ至る生態系の変化を解析し、森−里−海の連環について考察する。
［到達目標］
・森林観察、環境観測、魚類採集、底生動物採集、プランクトン・付着藻類採集などのフィールド調査手法を習得する。
・各種水質項目の分析、採集した動物の観察と同定、胃内容物の観察と食性分析など、フィールド採集された標本を分析する手法を習得する。
・フィールドデータの解析手法を学習する。
・多様な環境データ及び生物データを用いて、生態系間の連環のメカニズムを解析する手法を学ぶ。
［演習計画と内容］
8月上旬（8月6日から10日を予定）に5日間の日程で実施する。上記の担当教員に加えて、中川光博士（国立研究開発法人土木研究所・専門研究員）も指導にあたる予定である。
1日目：朝JR園部駅集合、公用車で芦生研究林へ移動、芦生研究林にて森林構造の観察、由良川源流域・上流にて調査（魚類、水生昆虫、付着藻類、水質など）。舞鶴水産実験所へ移動し宿泊。
2日目：由良川中・下流・河口調査（魚類、水生昆虫、プランクトン、水質など）。
3日目：水生昆虫・ベントス・魚類の分類、胃内容物分析、水質分析。
4日目：データ解析。
5日目：データ解析、成果発表会、午後JR西舞鶴駅前で解散。
［費用］
1日目集合時のJR園部駅までと5日目の西舞鶴駅からの公共交通機関の交通費（JR特急利用で合計約4200円）が必要。駅⇔調査地，調査地点間の移動は公用車を使用。宿泊費（1泊900円）と食費の実費が必要。
［参考書等］
山下洋・田中克『森川海のつながりと河口・沿岸域の生物生産』（恒星社厚生閣）ISBN: 978-4-
7699-1075-6
山下洋　他『里海フィールド科学 - 京都の海に学ぶ人と自然の絆』（京都大学学術出版会）ISBN: 978-4-8140-0445-4
［その他］
・本実習はフィールド科学教育研究センターの教育拠点公開実習としても実施されるため、他大学からの受講生も参加する。
・6月5日（金）18時半から開催する説明会（オンライン）で詳しい実施方法を説明するので、実習参加希望者は必ず出席すること。

【Ｂ班】森は海の恋人
［演習の概要・目的］
　日本の国土を代表する豊かな森と多様性に富んだ海は、川で不可分につながり、「森が海を育み、海も森を育む」関係にあるといわれています。しかし人類の経済効率最優先のふるまいによってこの連環は著しい影響を受け、森の破壊が海を著しく汚染しています。また東日本大震災は東北地方に大きなダメージを与え、人間社会のみならずその地方の自然にも大きな影響を与えました。この演習では、東北地方の気仙沼を訪れ、近年大きく世論を動かしつつある「森は海の恋人」運動の故郷を訪ねて、自然再生の意義や人と自然との共存のあり方を学びます。そして豊穣な沿岸海域とそれに隣接する陸域の生態系を観察し、復興しつつある自然と社会について学びます。
［到達目標］
　自然と人間の共存のあり方を学ぶことができる。東日本大震災からの復興のようすを見学することができる。　植樹を通じて森林の生物多様性を回復させる様子を見ることができる。理系、文系という概念を超えた地に足のついた活動というのは、どのようなものかを学ぶことができる。
［演習計画と内容］
　宮城県気仙沼市唐桑町にある水山養殖場をベースに、“森は海の恋人”運動の創始者である畠山重篤氏（カキ養殖業者、京都大学社会連携教授、NPO法人「森は海の恋人」代表・理事長）と畠山信氏（同法人副理事）の協力を得て、森と川と海とのつながりを、沿岸域や汽水域に生息する海洋生物の調査や、養殖業の様子、森林の観察などのフィールド実習を通して学びます。
　また東日本大震災からの復興の様子を見学します。
［費用］宿泊費3万円程度。別途、集合場所（東北新幹線「一ノ関」駅を予定）までの交通費（京都駅−一ノ関駅は新幹線利用で往復約46,000円）と食費も必要です。
［参考書等］
畠山重篤『森は海の恋人 (文春文庫)』(文藝春秋) ISBN:9784167717049
畠山重篤『リアスの海辺から—森は海の恋人 (文春文庫) 』(文藝春秋) ISBN:9784167656331
畠山重篤『漁師さんの森づくり -森は海の恋人-』(講談社) ISBN:9784062104111
畠山重篤『鉄で海がよみがえる (文春文庫)』(文藝春秋) ISBN:9784167838249
畠山重篤『牡蠣とトランク』(ワック) ISBN:9784898314333
畠山重篤『日本<汽水>紀行—「森は海の恋人」の世界を尋ねて』(文藝春秋) ISBN:9784163652801
畠山重篤『牡蠣礼讃 (文春新書)』(文藝春秋 ) ISBN:9784166605422
畠山重篤『森・川・海　つながるいのち (守ってのこそう！　いのちつながる日本の自然) 』(童心社) ISBN:9784494008315
畠山重篤『カキじいさんとしげぼう』(講談社) ISBN:9784062129893
京都大学総合博物館・フィールド研『森と里と海のつながり　京大フィールド研の挑戦』(株式会社 えい出版社) ISBN:4-7779-0142-4
［関連URL］
http://setoblo.blogspot.jp/2015/08/1.html (2015年度のこのILASセミナーのようす(これを起点に「その4」まであります))
http://www.mori-umi.org/ (NPO法人「森は海の恋人」ホームページ)
http://moriumiblog.naturum.ne.jp/ (ブログ：同法人事務局)
https://www.facebook.com/makoto.hatakeyama3 (フェイスブック：同法人畠山信副理事)
http://www.rinya.maff.go.jp/j/press/kaigai/120209.html (国連フォレストヒーロー　プレスリリース)
http://www.fserc.kais.kyoto-u.ac.jp/ (京都大学フィールド科学教育研究センター)
http://www.seto.kyoto-u.ac.jp/smbl/index.html (京都大学瀬戸臨海実験所)
［その他］
畠山重篤氏の著作を読んでおくことが望ましい。またここに示すNPO法人「森は海の恋人」のホームページなどを見て、どのような活動が実際に行われているかを見ておくことが望ましい。

【Ｃ班】森里海連環学実習II ：北海道東部の森と里と海のつながり
［演習の概要・目的］
　自然景観が気象・地象・海象・生物・人為の相互作用によって形成されていることを実体験することを目的に、北海道東部にある別寒辺牛川上流の自然度が高い森林域、牧草地として土地利用されている支流の上流部、別寒辺牛川中流に広がる湿原のなか、そして下流の厚岸湖・厚岸湾の生物調査、水質調査などを通して、森−川−里−海のつながりについて学習します。森と川と海が生物を通してつながっていること、さらに人間がそのつながりにどのように関わっているかを実習中に得られたデータや知見をもとに理解を深めることを目的としています。
［到達目標］
　北海道東部の森林に生育する樹木の同定、毎木調査の基本、昆虫相調査について学びます。土壌断面の作成と土壌形成過程の観察方法を学び、植物と土壌の関係を理解できるようになります。
水質分析の基礎と簡易測定法を習得します。河川及び沿岸域に生息する水生生物の採集方法を学び、消化管内容物から動物の餌を同定することにより、森と川・海との繋がりを理解することができる能力を養います。
海洋観測の基礎を学ぶことで、直接見ることのできない水の中の現象を考察する力をつけることができます。
［演習計画と内容］
　京都大学フィールド科学教育研究センターの北海道研究林標茶区の森林における植生・昆虫相及び土壌・水質調査実習、別寒辺牛川での生物・水質調査、厚岸湖・厚岸湾での生物調査をそれぞれ2日間程度ずつで行います。
　厚岸湖・湾での実習は、北海道大学北方生物圏フィールド科学センター厚岸臨海実験所の船舶と施設を使って実施します。
　実習中に、それぞれ30分程度下記の講義を行い、実習方法とデータ解析について学んだうえで、実習に取り組みます。講義は、京都大学フィールド科学教育研究センターと北海道大学北方生物圏フィールド科学研究センターの教員がそれぞれ担当します。
1.「森里海連環学の課題」（北海道大学教員）
2.「根釧地方の自然環境と産業」（北海道大学教員）
3.「生物の分類と同定」（小林）
4.「流域の土壌・植生と物質循環」（北海道大学教員）
5.「河川生物の調査法」（中山）
6.「水質分析法」（北海道大学教員）
7.「厚岸湖・厚岸湾の調査方法」（北海道大学教員）
8.「海洋環境と植物プランクトン」（北海道大学教員）
9. グループ発表「別寒辺牛川流域の森里海連環学−森・川・海・人間活動の視点から」（小林・杉山・中山・北海道大学教員）
＊ 事前説明会、履修登録等（杉山）

　実習生は、森、川、里、海の4つの班に分かれ、班単位で実習に取り組みます。樹木識別、毎木調査、昆虫相調査、土壌調査、水生生物調査などの野外調査を実習します。また、水質調査の基礎として、溶存成分の比色分析実習などを行います。
　レポートは、班ごとで毎木、昆虫、土壌、河川水生生物、厚岸湖水生生物調査について作成するとともに、実習生個人で、植生、昆虫、土壌、動物、水質などの中から４つ選択して作成します。また、各班それぞれの観点から別寒辺牛川流域全体の森川里海の連環について発表し、最終レポートを提出して実習を終了します。
［費用］
　食費等実費のほか、施設利用料などとして14,000円を現地で集めるため現金で持参してください。なお、実習地までの交通費は各自で負担してください。
［参考書等］
　テキストは実習初日に配布し、動植物の同定に関する図鑑等は、研究林、臨海実験所が保有するものを貸し出します。また、その他の参考書等については、実習中に行う講義の中で、適宜紹介します。

【Ｄ班】自然体験の感動を科学する
［演習の概要・目的］
　人はなぜ、自然を愛し、自然にいやされるのだろう。便利な都会で暮らしていても、なぜときとして自然体験を求めるのだろう。こんな疑問について、科学的な切り口でいどむのがこのILASセミナーの特徴だ。この授業では、自然が現代人の精神的幸福に貢献するメカニズムを探る。従来の「自然保護ありき」で語られる環境保全ではなく、進化生物学や心理学などの客観的な視点から、人々が自然を心地よく思い、愛し、敬う感情とは何か・その感情はいつどこで生じるかを考える。近年実用化の進む表情認識AIなどの情報技術を用いることで、従来は研究がむずかしかったフィールドでの人間行動と感情についての実験と研究を進める。実際に自然体験アクティビティを行い、その感動をデータとして分析する。これまでは文系の学問で漠然と語られるだけだった「自然のなかでの感動」を、科学で解明してみよう。
［到達目標］
　自然の価値について、特に文化的生態系サービスについての知識を得、また実際に自然体験をすることで、エコツーリズムが果たす役割とは何か、今後の社会にどのような貢献を果たすかを考えることができる。フィールド調査学習では、仮説を立て、データを取得して検証し、考察するというプロセスを体得する。その結果として、自然体験で生じる感動とは何かを考え、人にとってそれがどのような意味を持つかを分析する経験を積む。
［演習計画と内容］
　吉田キャンパスでの講義および実習の説明会を7月中に行う（第1回分）。その後、8月に京都大学紀伊大島実験所とその周辺で集中講義を実施する。フィールド体験は、講義および予備調査実験（第2-5回分）、フィールド調査学習（第6-11回分）、成果取りまとめと発表（第12-15回分）で構成される。講義では、日本人と自然のかかわりを歴史的コンテクストと現代の環境問題を通して学ぶ。また、人間の心理を形づくる要因を知るために進化生物学・進化心理学の基礎も学ぶ。フィールド調査学習では、人間の心理にとって自然の持つ役割は何かを、仮説を立て、調査によって検証し、考察するというプロセスを踏む。近年実用化の進む表情認識AIなどの情報技術を用いることで、人間の行動や感情を詳細に記録するビッグデータ科学の初歩を学ぶ。学生はグループごとに、来訪者に自然がもたらす精神的・文化的効果を明示的・定量的に調べ、自然に対する気持ちについての普遍性や法則性を探る。指導教員はそれぞれの仮説の設定や研究手法、結果の解析を指導する。
［費用］
旅費（JR串本駅までの往復交通費）・潮岬青少年の家の宿泊費用（1泊1,360円・2泊分）・食費・自然体験アクティビティ参加費用・その他実習参加に必要な経費は学生個人の負担となります。
［参考書等］
高校の生物で履修する程度の生態学の知識があることがのぞましいので、必要に応じて「学んでみると生態学はおもしろい（伊勢武史著・ベレ出版）」などの入門書を読んでおくことを勧めます。

【Ｅ班】森を育て活かす−林業体験をとおして考える
［演習の概要・目的］
　近年の地球環境問題の顕在化により，社会そのものが大きく変質せざるを得ない状況にあります。我々は今後，どのような未来社会を目指し，構築すべきか，その道筋を含めて考え，行動していかなければなりません。日本人は古くから様々な形で森林を改変し，利用しながら，独特の文化を育んできました。現在，日本には2,500万haの森林があり，国土に占める森林の比率（森林率）は68.5%（FAOによる数値）と，先進国の中では3位です。その4割（1,000万ha）が人工林化されており，充分な資源量を蓄積していますが，一方で林業不振のためにあまり利用されず，間伐遅れによる森林荒廃など，様々な問題を引き起こしています。本セミナーでは，植栽，下刈り，枝打ち，間伐，集材など，伝統的に日本で行われてきた林業作業を解説，体験するとともに，林業の現場の見学や山村で暮らす人々との交流を通し，これからの社会で，森林資源をどのように持続的に利用していくかについて考え，自然科学，社会学など様々な側面から議論します。
［到達目標］
　自分たちの生活と森林との接点を理解し，未来社会での森林との付き合い方を考え行動する基盤を身につける。特に，森林と密接に関係してきた日本文化を幅広く理解し，山村の過疎問題や日本社会の将来像について，具体的に自分なりの意見を述べることができるようになることを目標とする。
［演習計画と内容］
　長期間にわたり育成されてきた人工林において，森林調査，間伐，集材など，伝統的に日本で行われてきた林業作業を数日にわたり体験する（作業内容は調整中）。実施地は和歌山県北部を予定しているが変更する可能性がある。また，京都と現地との往復の間に，日本で最も古い林業地のひとつである奈良県吉野地域の製材品市場や，現存する270年生のスギ人工林を見学するほか，周辺地域の事業体における最先端の林業経営の見学，十津川村産材産直住宅の見学等を予定している。
［費用］
　移動は公用車を利用するため，期間中の交通費はかからないが，集合地点（近鉄橿原神宮前駅を予定）までの交通費，宿泊費（3泊，2万円程度）および食費等（1万円程度）は実費。
［参考書等］
長谷川尚史 『林業イノベーション−林業と社会の豊かな関係を目指して』（林業改良普及双書）ISBN:ISBN978-4-88138-333-9
［その他］自分の日常生活の中で，木材をはじめとする森林資源がどのような場面で人間社会で活用されているかを観察しておくこと。また，生活圏内にある森林に着目し，その管理状況を観察する（特に時間を割いて観察する必要はない）。観察した森林と森林資源の活用の現状について，それが持続可能な状態であるかどうか，また持続可能な状況にするために，自分の立場からどのように貢献できるかについて，考えておく。

【Ｆ班】京都の文化を支える森林−地域の智恵と生態学的知見
［演習の概要・目的］
　京都は豊かな森林・水などの自然に支えられ、その資源を利用することによって古より発展を遂げきた。多くの文明が環境破壊と生態系サービスの劣化によって失われた事実とは対照的に、京都周辺には現在でも多くの森林や渓流が残り、京都の文化を支えている。
　本演習では、京都市の里山や芦生の原生的な森林などで、森林と人間の関係を科学的に捉える研究手法を実習を通して学び、森林の利用に関する地域の歴史や人々の智恵を、猟師などの地域の多様な人と接するなかから学ぶ。そして、森林と人間社会との新しい関係を考える。
［到達目標］
　京都における森林の歴史や現在の状況を学習し、森林をめぐる環境問題に対し、実習を通じて科学的な知識や研究手法を習得する。加えて、地域の人々や活動を体験し、人間社会と森林の関係について考察し、多面的な視野から対応策を考えられるようになる。
［演習計画と内容］
　森林と人間の関わりに関する歴史的知見ならびに森林生態系に関する生態学的知識について学習する。その後、京都大学が有する、里山として利用されてきた上賀茂試験地、原生的な森林である芦生研究林にて実習を行う。森林と人間社会の関係について、植生（石原）や歴史・生活（坂野上）といった異なる側面から、調査を行い、科学的な研究の流れを理解する。さらに猟師や林業家など森林と関わる仕事をしている学外の講師の話を聞き、人工林やかやぶきの里を見学し、森林がどのように管理され、人々がどのように森林とともに生きてきたかを学ぶ。　
スケジュール（予定）
１日目　上賀茂試験地：京都市の里山
　　ガイダンス
　　上賀茂試験地の見学・チェーンソー体験（希望者）
　　芦生研究林へ移動・夕食
　　森と人との関わりについて猟師などの外部講師
２日目　　芦生研究林の自然と調査
　　午前　樹木種の識別実習、原生的森林の観察
　　午後　調査体験
　　夕食
３日目　　
　　かやぶきの里、木材市場などの見学
　　北白川試験地の見学
　　解散
［費用］
実習中の宿泊費・食費については実費（合計5000円程度）を徴収する。
初日の上賀茂試験地までの旅費は自己負担。
［参考書等］
森林立地学会編『森のバランス』（東海大学出版会）
石原正恵・赤石大輔・徳地直子　編『「大学の森」が見た森と里の再生学 京都芦生・美山での挑戦』（京都大学学術出版会）
中静透・菊沢喜八郎　編『森林の変化と人類』（共立出版）
高槻成紀『シカ問題を考える』（山と渓谷社）
京都伝統文化の森推進協議会『京都の森と文化』（ナカニシヤ出版）
［関連ＵＲＬ］
https://fserc.kyoto-u.ac.jp/wp/ashiu/2024/10/16/4981/（過去の実習の様子）
https://fserc.kyoto-u.ac.jp/wp/ashiu/(芦生研究林)
https://fserc.kyoto-u.ac.jp/wp/kamigamo/（上賀茂試験地）
http://www.fserc.kais.kyoto-u.ac.jp/ (京都大学フィールド科学教育研究センター)

【Ｇ班】里山の物質循環—燃料・肥料・食料から考える—
［演習の概要・目的］
　身近な自然から地球規模での課題についての理解を深めることを目的として、里山での物質循環の観点から燃料・肥料・食料の持続可能性について考えるための知識を習得し、関連する体験を通じて考察します。事前学習の講義では、里山生態系の特徴や生態学における物質循環の考え方や調査方法について学びます。さらに、京都市郊外に位置する上賀茂試験地において、都市近郊の里山において、フィールド実習を行います。フィールド実習では、物質循環研究に関連した土壌調査や植物調査を行うとともに、下草刈り、炭焼、シイタケの駒うちなど里山での作業体験を行います。さらに、取得したデータや既存のデータ等を活用して、また様々な作業の実体験を元に、里山の物質循環や燃料・肥料・食料の持続可能性について総合的に考察を行います。
［到達目標］
里山生態系の特徴を理解する。
生態系の物質循環の考え方を理解する。
物質循環に関する基本的な調査方法をフィールドワークを通して理解する。
里山での作業について理解する。
持続可能性について、物質循環の観点から考察する能力を身につける。
［演習計画と内容］
1.ガイダンスおよび里山生態系の特徴
2.里山生態系の物質循環
3.里山生態系の資源循環
4-7.里山でのフィールドワーク
（土壌調査、植物同定、植物調査、バイオマス調査）
8-11.里山での作業体験
（伐採、炭焼、下草刈、駒うち）
12-14.里山での燃料・肥料・食料に関するワーク
（燃料・肥料・食料に関する現地調査・文献調査）
15.討論：燃料・肥料・食料の持続可能性について考える

上賀茂試験地（京都市北区）で３日（日帰り）で行います。
［費用］
交通費（叡電往復700円程度、自転車だと０円）、昼食代等の実費
［参考書等］
石井弘明、徳地直子、榎木勉、名波哲、廣部宗編『森林生態学』(朝倉書店) ISBN:978-4-254-47054-3
［その他］
費用は特に発生しません。ただし、上賀茂試験地までの交通費や実習中の食事や飲み物などは各自で負担してください。
メールで本実習に関する連絡が届きますので、見落とさないようにして下さい。

【Ｈ班】安全安心な水循環系—健康関連微生物の調査を通して考える
［演習の概要・目的］
　私たちの生活に欠かせない水は、都市と自然の間を日々循環しています。かつては、水を介した感染症が社会にとって大きな脅威でしたが、上水処理や下水処理といったインフラの整備によって、安心・安全な水循環が築かれ、感染症のリスクは大きく抑えられてきました。しかし、依然として病原体が水を介して感染する事例は近年でも報告されており、さらに薬剤耐性菌という新たな課題も水循環との関係で議論されています。本演習では、実際に下水処理施設や河川を訪れ、水がどのように浄化され、環境をめぐり、我々に戻ってくるのかを観察します。さらに、糞便汚染の指標微生物（例：大腸菌）を対象に、下水、環境水、上水中の微生物量を測定し、水処理が健康リスクの低減において果たしている役割を理解します。また、薬剤耐性大腸菌の測定を通して、「サイレントパンデミック」と呼ばれる薬剤耐性の拡散実態を観察するとともに、水循環との関係について考察します。現場観察、実験、リスク評価を一貫して体験することで、未来の安心・安全な水循環について考える力を養います。
［到達目標］
・水循環における上下水インフラの役割を理解する
・下水処理プロセスの仕組みを説明できるようになる
・基本的な微生物測定法を体験し、その意義を理解する
・健康リスク評価の考えを学ぶ
・薬剤耐性問題と水循環の関係について説明できる
［演習計画と内容］
　滋賀県内の下水処理施設および河川を対象に
① 現地見学
② 採水
③ 微生物測定
④ データ整理・簡易リスク評価
⑤ 議論・発表
を行います。実際のデータを用いて、自ら考え、議論することを重視します。水や微生物に関心のある学生の参加を歓迎します。専門知識がなくても、基礎から学べる内容です。
［費用］
・集合場所（流域圏総合環境質研究センター）までの交通費　最寄りはJR膳所か京阪錦
・各日の食費
［参考書等］
・流域圏総合環境質研究センター：https://www.eqc.kyoto-u.ac.jp/
［その他］
・流域圏総合環境質研究センターのホームページを閲覧し、センターの研究内容を理解しておくこと。
・野外の採水では猛暑が想定され、下水処理施設では高温多湿なが想定されるため、こまめに水分補給を行うこと。体調がすぐれないときは、速やかに申し出ること。
・下水処理施設や河川では転落の危険や事故に遭遇するリスクが高いため、単独行動はせず、常に教員の指示に従うこと。特に、下水処理施設では採水時に支給するヘルメットを常時着用すること。
・採水時は汚れても良い服と靴とすること。

特になし。全回生向け。スタート時点では特定の知識は必要ではないが、授業中必要になる知識については、自学自習すること。

講義に関しては、授業への参加の状況および内容の理解力を確かめるためのレポートにより評価する。
少人数演習に関しては、各班で若干異なるが、実習への取り組み状況、発表やレポートで総合的に評価する。
各評価項目の割合の詳細は，初回の授業および少人数演習の初回の授業で説明する．

・参考文献を事前に勉強することを推奨します。
・少人数演習に関しては、授業中にそれぞれの担当教員から紹介します。

（1）学生教育研究災害保険、附帯賠償責任保険には必ず加入しておいて下さい。また、旅行保険に加入することをお奨めします。なお、保険加入にあたっては、家族等とよく相談してください。
（2）フィールドワークに関する費用は特に発生しません。ただし、実習地までの交通費、宿泊代の実費、実習中の食事や飲み物などは各自で負担する必要があります。詳細は各班の開催地や費用を参考にして下さい。
（3）LMSやメールで講義や少人数演習に関する連絡が届きますので、見落とさないようにして下さい。
（４）環境問題は自然科学にとどまらず、経済、法律、社会と密接に関係します。理系・文系両方の学生の受講を歓迎します。
（５）夏休み期間中に少人数演習を実施するため、前期の成績報告に間に合わないため、後期に前期成績として発表されることがあるので、注意してください。
（６）少人数演習の期間中、とくに野外での活動の際には、教員・ティーチングアシスタント・技術職員等の指示、注意をよく守って行動するようにしてください。
（７）一部他大学の実習生と合同で行う少人数演習があります。
（８）参加を希望する演習についてのアンケートは2回（初回講義と第10回講義）実施します。希望する演習の定員を超える場合は抽選となり、必ずしも希望する演習には参加できない場合があります。定員に余裕がある場合に限り、履修登録時（もしくは初回アンケート）で希望した少人数演習から変更することができます。
（９）各種調査許可申請や宿泊受入準備などの都合で、第10回の講義までに参加する少人数演習を決定します。第5回の講義のアンケート後（概ね5月下旬）に参加する少人数演習を決定します。
（１０）教室の定員を超える場合には履修（人数）制限を行います。無作為抽選により結果をKULASISで発表します。

※成績証明書等では、表示文字数の制約上、英文科目名「Integrated Liberal Arts and Science with Small Group Seminars」が「ISS」と略記されます。

Behavioral Neuroscience investigates the neural basis of behavior. This course combines the old Part A and Part B into a single course, and thus accelerates the speed of material.

The first 4 lectures introduce basic neuroanatomy, neural functioning (membrane potential, action potential, synapses), and neuroscience methods (MRI, PET, EEG, electrophysiology).

The next 5 lectures introduce basic sensory and motor circuits: vision, audition, somatosensation and pain, muscle and motor control, and multisensory integration.

The final 5 lectures introduce cognitive behavioral neuroscience, focusing on memory and learning, development, language, consciousness, and neuropsychiatric disorders.

The course will employ an integrative approach by discussing both research results obtained with brain imaging in humans and experiments in animal models.

- To understand how our brain processes information.
- To understand the methods used to investigate the brain and behavior.
- To be able to critically evaluate research findings in behavioral neuroscience reported in the public and scientific media.

1) Introduction and Anatomy
2) Cells in the nervous system (Axons, Dendrites, Soma). Membrane Potential.
3) Action Potential and Neurotransmitters/synapses.
4) Methods in Behavioral Neuroscience (MRI, EEG, electrophysiology)
5) Vision
6) Audition
7) Touch and pain
8) Muscles and Motor Control
9) Multisensory Integration (and development)
10) Learning and Memory (Hippocampus, LTP)
11) Language
12) Executive Function and Consciousness
13) Emotion and Social Processing (Mirror Neurons)
14) Diseases and Disorders (Schizophrenia, Dementia, Autism)

15) Feedback

Basic knowledge of high-school level biology, chemistry, and physics is recommended.

Evaluation will be based on class attendance and active participation (5 points) based on in-class quizzes and discussions, a final report (50 points), 10 random in-class open-note quizzes (10 points), and 15 online open-note quizzes (35 points).

To achieve the course goals students should review the course materials plus optionally the according chapters in the recommended text books after each class. The time necessary for review should be in the range of 1-3 hours per class.

No fixed office hours, but students are welcome to arrange appointments by email.

現代的な生物学，特に細胞以下のミクロレベルの生物学の基礎を身に付けるため、大学レベルの標準的教科書である「Essential細胞生物学」を教材に講義する。まず、DNAやタンパク質などの生物に特徴的な分子が細胞内でどのような機能を持つのか、またこれらの分子の機能がどのような構造的特徴に由来するかを講述し、さらに、これらの分子が、細胞・個体レベルの各種生命現象にどのように関係するかを概説する。本講義の内容は、さらに専門的な生物系の授業を履修するために必要な基礎となる。

生命科学の基本的事項について細胞を中心に分子から個体まで理解する。生命科学に関する議論を考察できる知識と思考を身につける。

本講義では生物学のうち、生命現象と物質（細胞と分子、生物と遺伝子、体内環境の維持、代謝など）、生物の環境応答、生殖と発生、生物の進化と系統の基礎知識を身に付けるとともに、科学的な思考力、判断力及び表現力を育成する。

第１回：細胞とは　細胞の内部構造と大きさ、光学顕微鏡像、電子顕微鏡像を解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第２回：細胞の化学成分　細胞内構造を構成する物質の特徴について解説する。「生命現象と物質」
担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第３回：エネルギー、触媒作用、生合成　自由エネルギー、酵素の触媒作用について解説する。　「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第４回：細胞がエネルギーを得るしくみ　ミトコンドリアによる糖からエネルギーを得る呼吸、葉緑体における光合成のしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第５回：タンパク質の構造と機能　タンパク質の構造、タンパク質とその機能の例について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第６回： DNAと染色体　遺伝情報としてのDNAの構造と特徴、染色体の構造について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第７回： DNAの複製　DMAの複製のしくみとそこで働くタンパク質について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第８回： DNAからタンパク質へ　遺伝情報がDNAから取り出され、それに従ってタンパク質が合成されるしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第９回： 遺伝子発現の調節　mRNA タンパク質発現をどの段階でどの様に調節するかのしくみについて解説する。「生命現象と物質、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１０回： 細胞の情報伝達　細胞同士の相互作用のしくみについて解説する。「生物の環境応答」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１１回：細胞骨格と細胞接着　生物の体を形成する又は維持するために必要な細胞接着、それを支える細胞骨格について解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１２回：細胞分裂と細胞周期　生物の成長と維持に必要な細胞増殖とそのしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１３回：減数分裂と染色体の組み換え　配偶子を生み出す減数分裂のしくみ、減数分裂と体細胞分裂との相違、減数分裂中におきる染色体の組み換えについて解説する。「生殖と発生」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１４回：植物と動物の発生　植物、動物の配偶子形成、受精、卵割、細胞分化と形態形成のしくみを解説する。「生殖と発生、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
≪定期試験≫
第１５回：フィードバック　（質問に対応して解説）担当：全員

特になし

セメスター末に、授業内容全般に関する筆記試験を実施する。平常点などの取扱いについては、クラスごとに最初の授業で説明する。

配付資料などの復習をすすめる。

「個体と集団の基礎生物学」とともに受講することで、現代の生物学全体を概観できる。

現代的な生物学，特に細胞以下のミクロレベルの生物学の基礎を身に付けるため、大学レベルの標準的教科書である「Essential細胞生物学」を教材に講義する。まず、DNAやタンパク質などの生物に特徴的な分子が細胞内でどのような機能を持つのか、またこれらの分子の機能がどのような構造的特徴に由来するかを講述し、さらに、これらの分子が、細胞・個体レベルの各種生命現象にどのように関係するかを概説する。本講義の内容は、さらに専門的な生物系の授業を履修するために必要な基礎となる。

生命科学の基本的事項について細胞を中心に分子から個体まで理解する。生命科学に関する議論を考察できる知識と思考を身につける。

本講義では生物学のうち、生命現象と物質（細胞と分子、生物と遺伝子、体内環境の維持、代謝など）、生物の環境応答、生殖と発生、生物の進化と系統の基礎知識を身に付けるとともに、科学的な思考力、判断力及び表現力を育成する。

第１回：細胞とは　細胞の内部構造と大きさ、光学顕微鏡像、電子顕微鏡像を解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第２回：細胞の化学成分　細胞内構造を構成する物質の特徴について解説する。「生命現象と物質」
担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第３回：エネルギー、触媒作用、生合成　自由エネルギー、酵素の触媒作用について解説する。　「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第４回：細胞がエネルギーを得るしくみ　ミトコンドリアによる糖からエネルギーを得る呼吸、葉緑体における光合成のしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第５回：タンパク質の構造と機能　タンパク質の構造、タンパク質とその機能の例について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第６回： DNAと染色体　遺伝情報としてのDNAの構造と特徴、染色体の構造について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第７回： DNAの複製　DMAの複製のしくみとそこで働くタンパク質について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第８回： DNAからタンパク質へ　遺伝情報がDNAから取り出され、それに従ってタンパク質が合成されるしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第９回： 遺伝子発現の調節　mRNA タンパク質発現をどの段階でどの様に調節するかのしくみについて解説する。「生命現象と物質、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１０回： 細胞の情報伝達　細胞同士の相互作用のしくみについて解説する。「生物の環境応答」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１１回：細胞骨格と細胞接着　生物の体を形成する又は維持するために必要な細胞接着、それを支える細胞骨格について解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１２回：細胞分裂と細胞周期　生物の成長と維持に必要な細胞増殖とそのしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１３回：減数分裂と染色体の組み換え　配偶子を生み出す減数分裂のしくみ、減数分裂と体細胞分裂との相違、減数分裂中におきる染色体の組み換えについて解説する。「生殖と発生」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１４回：植物と動物の発生　植物、動物の配偶子形成、受精、卵割、細胞分化と形態形成のしくみを解説する。「生殖と発生、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
≪定期試験≫
第１５回：フィードバック　（質問に対応して解説）担当：全員

特になし

セメスター末に、授業内容全般に関する筆記試験を実施する。平常点などの取扱いについては、クラスごとに最初の授業で説明する。

配付資料などの復習をすすめる。

「個体と集団の基礎生物学」とともに受講することで、現代の生物学全体を概観できる。

Land plants adapt to the environment and at the same time have developed distinctive structures and functions that have great influence on the environment as well. In this lecture we outline the physiological, morphological and anatomical characteristics that are the basis of the growth and survival of plants. We will discuss how these attributes are integrated and coordinated at the whole plant level to better understand the ecology of species both in their natural range and when used in agriculture and forestry. This course broadly introduces the physiological functions of plants in an ecological perspective.

Upon successful completion of this course, students will be able to understand the physiological processes underlying plant growth and development, how environmental factors influence these processes, and how knowledge of plant physiology is useful for crop, grassland and forest management.

Course schedule:
1. Introduction to plant physiology in an ecological perspective
2. Leaf photosynthesis: adaptation to sun and shade
3. Carbon assimilation and temperature
4. C3 and C4 plants in an evolutionary perspective
5. Respiration and carbon use efficiency
6. Effects of environmental factors on plant respiration
7. Growth and allocation
8. Storage of carbohydrates
9. Long distance transport of carbohydrates
10. Mineral uptake and translocation
11. Nutrient productivity and nutrient use efficiency
12. Water in cells, plants and soils
13. Water transport in plants
14. Control of plant water loss
≪End of Term Exam≫
15. Feedback

Beneficial but not mandatory: basic knowledges in biology (high school)

Grading: Quizzes or questions based on previous class contents (after each class on LMS, 50%), end of term exam (50%).
In no case will English language proficiency be a criterion for evaluating students. Tests and exams are designed to allow short answers.
Class attendance is expected: students who are absent more than three times without sound reasons (documented unavoidable absence) will not be credited.

Students are expected to review the course content of previous classes and to read the materials distributed before each class (about two hours between two classes).

Students are encouraged to ask questions and to make comments during the class.
Students are welcome to arrange appointments by email, even outside the official office hour, for questions and discussion.

脳は、神経細胞により高度に組織化された器官である。脳は、外部・内部環境の変動を感覚器などを用いてとらえ、それを適切に処理することができる。この際、脳はどのようにして外界の状況を把握し、どのように処理していくのかを学ぶ。鍵となる概念を学び、さらにその最先端を概観する。

脳の機能を作り出す神経細胞の基本的な機能、及び単純な神経系から作り出される脳の機能についての知識を習得する。

フィードバックを含め全15回で、以下のような課題について講義を行う。
様々な外部環境因子の変動、あるいは体内状況の変動に対して、脳を介して自律的な応答と行動を伴う応答が起こる。この生体応答がどのようにして起こるのかをついて講義を行う。環境の変化を読み取る仕組みと、その環境変化に対して起こる生体応答がおこる仕組みについて、生理学、分子生物学の立場から解説する。以下のトピックについて講義を行う。1課題あたり１〜２回の授業をする予定である。

１　神経系の成り立ち
２　脳の機能分担
３　神経細胞の動作原理
４　神経の可塑性
５　神経の計算理論の基礎
６　神経系によって外部刺激を受け取るしくみ
７　神経系によって体内情報を受け取るしくみ
８　システムからみた神経系による調節応答

文系学生は高校で数学、物理、化学を履修した程度
スタート時点では生物の知識は必要ではないが、授業中必要になる知識については、授業内で適宜補足する。

定期試験による。

予習については次回の内容を授業中に指示します。
復習については授業を振り返り、わからないことがあれば、フィードバックしてください。

生物を勉強したことのない人も対象にしています。

本実習はミクロ系生物学の基礎的な実験手法を修得することを目的とする。具体的には、身の回りの微生物観察や培養および分子生物学実験よりなる。微生物は、あらゆる環境に棲息し、人間活動に深く関わっている。身近な微生物の観察、分離・培養を通して、微生物の多様性について認識するとともに、微生物の取り扱いにおける基礎を修得する。また、分子生物学実験は、すでに現代社会と密接に関係した生命科学の基礎を担っている。たとえば、iPS細胞に代表される再生医療、世界で広く流通している遺伝子組換え作物創成において分子生物学実験の知識は必要不可欠である。分子生物学実習ではDNAの調製や解析を主として行う。

身近な微生物の多様性を知り、微生物の取扱いに関する基本的実験方法を習得する。また、分子生物学の基礎的実験手法を習得する。

第１回：ガイダンス
第２回：顕微鏡の使い方
第３回：微生物の観察　（発酵食品・環境中の微生物）
第４回：実験器具の滅菌１、培地の調整・滅菌１（試薬の計量、分注器の使い方、オートクレーブ法）
第５回：培地の調製・滅菌２、寒天平板の作製
第６回：食品、土壌、その他からの微生物の分離（希釈の方法、線画法、塗布法）
第７回：分離した微生物の観察１（生菌数計数、コロニーと細菌形態の観察、グラム染色、ペーパーディスク法による抗生物質の評価）
第８回：分離した微生物の観察２、ペーパーディスク法による抗生物質試験結果の評価
第９回：試薬類の調製
第１０回：生物からのタンパク質とDNAの調製
第１１回：電気泳動によるタンパク質の分析
第１２回：PCRによるDNAの増幅と制限酵素によるDNAの切断
第１３回：電気泳動によるDNAの分析
第１４回：DNAの塩基配列の解析
第１５回：フィードバック

実習内容の順序は前後する可能性がある

１回目の授業（ガイダンス）を吉田南２号館２階の生物実習室２（D211）で行う。履修希望者は必ずガイダンスに出席し、申込み名簿に所定の事項を記入すること。ただし、希望者が受入れ可能人数を超過した場合には、１回目の授業時に抽選を行う。高校等での生物の履修経験の必要は無い。スタート時点では微生物学・生化学の知識は必要ではないが、実習に必要になる知識については、実習中に適宜補足する。

実習への参加状況や取り組み方などの平常点、および実習後のレポート内容に基づいて評価する。

実習書をLMSにアップロードするとともに、印刷物を第2回目の実習の際に配布するので、実習前に予習すること。実習後は実習によって得られた結果等を整理すること。

詳細については、履修受付の際に掲示する。
文系の学生にとっても難しくない。
受講者は傷害保険（学生教育研究災害傷害保険）へ加入すること。

This class will provide an introduction to genetics and evolution, starting with the most fundamental topics. What are chromosomes? What is the genetic code? Students will learn some of the basics about DNA, the genetic material, and the Central Dogma of Molecular Biology. Then we will progress to specific topics such as mitosis and meiosis, genetic variation, and cancer and other genetic diseases in humans.
The latter half of the course is devoted to topics in evolutionary biology. We will cover the basic concept of common descent with modification, and discuss the meaning of terms such as natural selection and fitness. We will learn about subjects like the classification of life, the genetics of evolution, conflict and cooperation, sex and reproductive success, and finish with some social and historical considerations of evolutionary theory and society. Students should come to appreciate that we can explain the apparent paradox of the great diversity and unity found in living things through understanding evolution, the "unifying theory of biology".

Students will become familiar with molecular biology, classical genetics, central dogma, genetic diseases, and learn some basic principles of evolution including natural selection, adaptation, fitness, genetic drift, phylogenetics, and the last universal common ancestor.

1. Introduction
2. The Structure of DNA and Chromosomes
3. Coding and noncoding RNA
4. Gene Expression
5. Mitosis and Meiosis
6. Genetic Variation
7. Cancer and Genetic Diseases in Humans
8. Introduction to Evolutionary Biology
9. The Tree of Life: Classification and Phylogeny
10. Genes and Evolution
11. Conflict and Cooperation
12. Sex and Reproductive Success
13. A Brief History of Life on Earth
14. Evolution, Science and Society
≪Final Exam≫
15. Feedback Class

This is an introductory course. There are no requirements but high school-level knowledge of biology is highly recommended. The course will be taught in English. Some students may have some knowledge of biology but maybe not in English language. Other students may have good English skills, but will have to learn some technical terms used in the study of genetics and evolution.

Lectures will encourage student participation. There will be a final exam and some in-class quizzes to assess comprehension of the subjects taught. Final grades are assessed by: attendance and student participation: 20%; quizzes: 30%; final exam: 50%.

Students may need 2-3 hours per week to review the lecture material and look up any background information as necessary. Some students may know the subject already, but need to learn the English vocabulary; others may need to learn both Biology and English.

In principle, anytime. Please contact the instructor by e-mail if you have any questions. For consultations about course-related matters outside class hours, please make an appointment directly or by e-mail.

現代的な生物学，特に細胞以下のミクロレベルの生物学の基礎を身に付けるため、大学レベルの標準的教科書である「Essential細胞生物学」を教材に講義する。まず、DNAやタンパク質などの生物に特徴的な分子が細胞内でどのような機能を持つのか、またこれらの分子の機能がどのような構造的特徴に由来するかを講述し、さらに、これらの分子が、細胞・個体レベルの各種生命現象にどのように関係するかを概説する。本講義の内容は、さらに専門的な生物系の授業を履修するために必要な基礎となる。

生命科学の基本的事項について細胞を中心に分子から個体まで理解する。生命科学に関する議論を考察できる知識と思考を身につける。

本講義では生物学のうち、生命現象と物質（細胞と分子、生物と遺伝子、体内環境の維持、代謝など）、生物の環境応答、生殖と発生、生物の進化と系統の基礎知識を身に付けるとともに、科学的な思考力、判断力及び表現力を育成する。

第１回：細胞とは　細胞の内部構造と大きさ、光学顕微鏡像、電子顕微鏡像を解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第２回：細胞の化学成分　細胞内構造を構成する物質の特徴について解説する。「生命現象と物質」
担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第３回：エネルギー、触媒作用、生合成　自由エネルギー、酵素の触媒作用について解説する。　「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第４回：細胞がエネルギーを得るしくみ　ミトコンドリアによる糖からエネルギーを得る呼吸、葉緑体における光合成のしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第５回：タンパク質の構造と機能　タンパク質の構造、タンパク質とその機能の例について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第６回： DNAと染色体　遺伝情報としてのDNAの構造と特徴、染色体の構造について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第７回： DNAの複製　DMAの複製のしくみとそこで働くタンパク質について解説する。「生命現象と物質」担当：船山、嶋田、山下、佐藤、今元
第８回： DNAからタンパク質へ　遺伝情報がDNAから取り出され、それに従ってタンパク質が合成されるしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第９回： 遺伝子発現の調節　mRNA タンパク質発現をどの段階でどの様に調節するかのしくみについて解説する。「生命現象と物質、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１０回： 細胞の情報伝達　細胞同士の相互作用のしくみについて解説する。「生物の環境応答」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１１回：細胞骨格と細胞接着　生物の体を形成する又は維持するために必要な細胞接着、それを支える細胞骨格について解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１２回：細胞分裂と細胞周期　生物の成長と維持に必要な細胞増殖とそのしくみについて解説する。「生命現象と物質」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１３回：減数分裂と染色体の組み換え　配偶子を生み出す減数分裂のしくみ、減数分裂と体細胞分裂との相違、減数分裂中におきる染色体の組み換えについて解説する。「生殖と発生」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
第１４回：植物と動物の発生　植物、動物の配偶子形成、受精、卵割、細胞分化と形態形成のしくみを解説する。「生殖と発生、生物の進化と系統」担当：今元、小山、寺川、秋山、嶋田
≪定期試験≫
第１５回：フィードバック　（質問に対応して解説）担当：全員

特になし

セメスター末に、授業内容全般に関する筆記試験を実施する。平常点などの取扱いについては、クラスごとに最初の授業で説明する。

配付資料などの復習をすすめる。

「個体と集団の基礎生物学」とともに受講することで、現代の生物学全体を概観できる。

Life is everywhere; in oceans, forests, and within every cell of your body, but what makes it work?

This course offers a broad introduction to the biosciences, exploring how chemistry gives rise to living systems and how those systems evolve, interact, and adapt.
Students will journey from the molecules that make up life to the complex structures and behaviors of plants and animals.
Along the way, we’ll uncover how genes shape diversity, how brains sense and respond to the world, and how ecosystems sustain life on Earth.
Through lectures, discussions, and presentations, students will not only gain a foundation in modern biology but also develop confidence in understanding and communicating biological ideas in English.

Students will gain an understanding of the diversity of Bioscience and its importance in our daily lives.
Students will develop the ability to understand and discuss various aspects of Bioscience in English, as well as to read, understand, and think critically about Bioscience in the media, such as in news reports, newspaper articles, and scientific journal articles.

1. Introduction to the course; Chemistry of life
2. Cell structure
3. Genetics
4. Biological Diversity
5. Viruses
6. Plant Biology
7. Mid-term exam + Feedback,
Explanation of Class Presentations
8. Animal Form and Function
9. The Nervous system
10. Sensory Systems
11. Class Presentations
12. The Immune System
13. Evolution
14. Ecology
≪Final exam≫
15. Feedback

This is an introductory course and prior knowledge of the topic is not necessary. All essential knowledge for the class and exams will be provided in class. Students need only to have a curiosity about the study of life.

Attendance & Participation 25%.
Midterm Exam (Multiple Choice) 25%.
Class presentation (Short Oral Talk) 25%.
Final Exam (Multiple Choice) 25%.

Review from the textbook, previous lecture content, and preparation for class presentation to be presented.

The contents of the syllabus are a guide to the content of the course, the exact content may change. Input and suggests from students are very welcome and I am happy to discuss the course material with students via email or in-person meeting.

植物を対象にした進化、環境への適応に関する基礎的な事項の理解と知識を深めること を目的とします。

地球上には様々な環境があり、植物はたくましく適応して生きています。植物は種子が発芽した場所から動くことが出来ません。環境が気に入らなければ移動が出来る動物と大きく異なります。そのために、生育環境に「適応できるか・否か」は、まさに生死をかけた事柄です。ここに植物を適応進化の研究対象にする魅力とアドバンテージがあります。
この講義では、乾燥、水辺、水中、高山、極地、島嶼のような環境の中で、植物たちがどのように逞しく適応して進化を続けてきたのか、について学習することを主な目的にします。
また、私が取り組んでいる「植物系統地理学」と「保全生物学」が、上記の課題とどのように関わっているかについても紹介します。

一人でも多くの受講者に、植物学を「面白い」と思って貰うことを目標にしています。

・さまざまな環境ストレスに対して植物がどのように適応しているかについて、進化学、形態学、集団遺伝学、生理学、形態学の分野の知識と考察能力を修得する。
・環境問題（生物多様性や温暖化の影響など）の知識を修得して、将来の日本や世界の状況について考察する能力を養う。

フィードバックを含め全15回で、以下のような課題について、記載の順番通りに、1課題あたり1〜2回の授業を行う予定です。多面的に「系統，分類，形態，生理，遺伝学的側面」から解説します。

（学習内容のキーワード）

乾燥への適応 （環境適応、葉の形、Ｃ４光合成、ＣＡＭ）
水界への適応
　・渓流沿い植物 （葉の形、光合成、適応形態）
　・水生植物 （葉の形、光合成、送粉様式、アブシジン酸とエチレン）　
　・マングローブ植物 （環境適応、気根、耐塩性、浸透圧）
高山への適応 （環境適応、矮小化、系統地理、第四紀気候変動）
島嶼における進化 （海洋島、進化、適応放散、固有種の進化）
日本の固有植物の系統地理と保全生物学

スタート時点では高校の生物学の知識は必要ではないが、授業中必要になる知識については、自学自習を求める。

成績評価は定期末試験だけで行います（100％）

下記のURLを参考にして下さい。

研究室のHP
http://setolab.h.kyoto-u.ac.jp/research.html

京都大学OCW動画（京都大学春秋講義の動画で、講義の内容を多く含んでいます）
https://www.youtube.com/watch?v=esmSa_1ROQ8

そしてさらに図書館の情報を使って、関連する項目を自分で調べてみることも大切だと考えます。授業の項目ごとに自ら資料を探すこともしてみてください。

個人の関心に合わせて、適切な参考書を紹介します。主体的に、教師に話しかけて下さい。メールではなく、毎週、教室で会った時に対話しましょう。
オフィスアワー：理系の教員なので基本的に毎日研究室で仕事をしています。オフィスアワーは限定していません。ただし出張で不在のこともあるので、事前に相談して下さい。

　現代の生命科学は技術の発達により進歩して来た。必要は発明の母的に開発された技術もあれば、他分野で発達した技術を応用した場合もある。

　生命科学の歴史を技術的側面から眺める事により、過去の技術が如何なる論理で開発されて来たか、将来開発されるべき技術とはどのようなものか理解してもらう。

　講義は生物学・化学の基本的な内容から丁寧に説明し、専門課程での関連科学が理解しやすいレベルにまで到達出来る様にする。一般的な生物学の講義では技術に関してあまり詳しく説明されないので、補完する講義として有用であると思われる。

　文系の学生でも、生物系の知識は現代社会生活・経済活動を行う上で役立つので積極的に履修して欲しい。

現代の生物科学を基礎から応用まで、技術的側面から理解できるようになる。

フィードバックを含む全15回の授業で、以下の項目をそれぞれ1-2週にかけて解説する。

(1) 生物学の基礎
(2) 顕微鏡の原理から最新技術まで
(3) DNA・RNAの構造と関連技術
(4) タンパク質の機能・研究手法
(5) 遺伝子操作技術
(6) モデル生物を用いた研究
(7) 歴史的研究から学ぶ
(8) 幹細胞技術・再生医学

スタート時点では生物学の知識は必須ではないが、授業中必要になる知識については、授業内で適宜補足する。

期末試験(筆記）による評価＋出席と参加の状況（70：30）

復習は授業で提示されるキーワードの理解を中心にして下さい。

オフィスアワーは特に設けないが、理解し難い点があれば適宜メールで予約して面談可です。

In this introductory lecture, we will learn about the molecular chemical basis of life. Emphasis of this course includes fundamentals of the components that form the backbone of the cell (proteins, nucleic acids, sugars, and lipids), as well as enzyme chemistry and the role of typical proteins. Finally, we will discuss on the link between biochemistry and human diseases, such as enzyme gene deficiencies, and how to treat them.

As all matter is composed of molecules, modern life science aims to explain all aspects of life comprehensively from the molecular level to that of the entire organism. In this lecture, students will attain a basic understanding of the molecular design of life, that is how biomolecules work and cooperate with each other to fulfill virtually all actions exerted by living beings.

1.Introduction to biochemistry
2. Amino acids (1): Structure
3. Amino acids (2): Function
4. Peptide and protein structure
5. Enzymes (1): Kinetic theory
6. Enzymes (2): Inhibitors
7. Enzymes (3): Enzyme activity
8. Cell structure and function
9. Nucleic acids and nucleotide (1) : Structure and function
10. Nucleic acids and nucleotide (2) : Central dogma
11. Monosaccharides and polysaccharides
12. Lipids and phospholipids
13. Methods in biochemistry
14. Introduction to metabolism
≪Final exam≫
15. Feedback

特になし

Evaluation will be based on class attendance and participation (~30 %), a report (~ 10%) and a final examination (~60 %).

I recommend students to confirm the handouts for each lecture and the relevant reference textbooks to learn about the lecture content in advance of the class. Handouts for each lecture will be uploaded on LMS approximately one week before each class.

Students are welcome to ask any questions in the class. Consultation via email or online meetings such as Zoom is possible. For those students who prefer to discuss directly with me beyond class hours, please arrange appointments by email in advance.

In this introductory lecture, we will learn about the molecular chemical basis of life. Emphasis of this course includes fundamentals of the components that form the backbone of the cell (proteins, nucleic acids, sugars, and lipids), as well as enzyme chemistry and the role of typical proteins. Finally, we will discuss on the link between biochemistry and human diseases, such as enzyme gene deficiencies, and how to treat them.

As all matter is composed of molecules, modern life science aims to explain all aspects of life comprehensively from the molecular level to that of the entire organism. In this lecture, students will attain a basic understanding of the molecular design of life, that is how biomolecules work and cooperate with each other to fulfill virtually all actions exerted by living beings.

1.Introduction to biochemistry
2. Amino acids (1): Structure
3. Amino acids (2): Function
4. Peptide and protein structure
5. Enzymes (1): Kinetic theory
6. Enzymes (2): Inhibitors
7. Enzymes (3): Enzyme activity
8. Cell structure and function
9. Nucleic acids and nucleotide (1) : Structure and function
10. Nucleic acids and nucleotide (2) : Central dogma
11. Monosaccharides and polysaccharides
12. Lipids and phospholipids
13. Methods in biochemistry
14. Introduction to metabolism
≪Final exam≫
15. Feedback

特になし

Evaluation will be based on class attendance and participation (~30 %), a report (~ 10%) and a final examination (~60 %).

I recommend students to confirm the handouts for each lecture and the relevant reference textbooks to learn about the lecture content in advance of the class. Handouts for each lecture will be uploaded on LMS approximately one week before each class.

Students are welcome to ask any questions in the class. Consultation via email or online meetings such as Zoom is possible. For those students who prefer to discuss directly with me beyond class hours, please arrange appointments by email in advance.

46億年の地球の歴史の中で、 38億年前に出現した初期の単純な生命から我々人類を含む多様な生物が進化した。生物がどのように多様化し、他種の生物がどのように関わりを持ちながら生きているかについて解説する。担当教員の専門を活かして、専門分野への導入を含めながら、高校で生物学を履修していなかった学生でも理解できるような分かりやすい授業を行う。

個体・集団を主に扱う専門的な生物学の基礎的な知識を習得する。地球上のさまざまな環境条件における生物の生存戦略とその進化、多様な生物種が共存するメカニズムに関する基礎的事項を理解する。

各クラスの担当教員は初回授業にて説明する。
以下の主題について、フィードバックを含め全15回で、それぞれ２〜５週の授業を行う予定である。 ［］内は主な項目。
（１） 生物の系統進化
地球上の生命の起源と進化史の概要、生物の系統進化、多様化について解説する。また植物と動物を中心に、分類体系についても最新の知見を紹介する。［生命の起源、原核生物、真核生物、細胞内共生、陸上植物、コケ植物、シダ植物、維管束、種子植物、オピストコンタ、後生動物、海綿動物、刺胞動物、左右相称動物、旧口動物、新口動物、らせん卵割動物、脱皮動物］
（２） 生物の生態と進化
生物の環境への適応について、遺伝の仕組みと自然選択（淘汰）による進化を基に解説する。その上で、集団（個体群）、群集、生態系の構造、存在様式、機能について解説し、生物多様性に関する最新の知見について紹介する。［遺伝システム、進化の仕組み、自然選択、適応、生活史、個体群動態、種間関係、生物群集、食物網、バイオーム、生態系機能、生物多様性］
（３） 動物の行動
時間的空間的に変異する環境における、動物の多様な行動パターンと機能について、適応的な観点から解説する。［適応度、性選択、血縁選択、利他行動、外温動物、防御行動、意思決定］
（４） 人類の特性と進化
ヒトを含む霊長類の生物学的特性を形態、行動、生態を中心に解説し、現生のヒトに至る人類の進化史について最新の知見を紹介する。［分類、分布、樹上適応、把握性、視覚、食性、大脳化、性差、社会構造、直立二足性、犬歯の退縮、道具使用、分娩、現代人の拡散・遺伝的多様性］

スタート時点では高校レベルの生物学の知識は必須ではない。授業中必要になる知識については、授業内で適宜補足する。また、必要に応じて自学自習も求める。

セメスター末に試験を実施して評価する。

予習・復習として生物学の一般的教科書や各専門分野の入門書等を読むことが望ましい。また、授業内容や書籍の内容について、疑問点があれば、担当教員に質問すること。

「細胞と分子の基礎生物学」とともに受講することで、現代の生物学全体を概観できる。

46億年の地球の歴史の中で、 38億年前に出現した初期の単純な生命から我々人類を含む多様な生物が進化した。生物がどのように多様化し、他種の生物がどのように関わりを持ちながら生きているかについて解説する。担当教員の専門を活かして、専門分野への導入を含めながら、高校で生物学を履修していなかった学生でも理解できるような分かりやすい授業を行う。

個体・集団を主に扱う専門的な生物学の基礎的な知識を習得する。地球上のさまざまな環境条件における生物の生存戦略とその進化、多様な生物種が共存するメカニズムに関する基礎的事項を理解する。

各クラスの担当教員は初回授業にて説明する。
以下の主題について、フィードバックを含め全15回で、それぞれ２〜５週の授業を行う予定である。 ［］内は主な項目。
（１） 生物の系統進化
地球上の生命の起源と進化史の概要、生物の系統進化、多様化について解説する。また植物と動物を中心に、分類体系についても最新の知見を紹介する。［生命の起源、原核生物、真核生物、細胞内共生、陸上植物、コケ植物、シダ植物、維管束、種子植物、オピストコンタ、後生動物、海綿動物、刺胞動物、左右相称動物、旧口動物、新口動物、らせん卵割動物、脱皮動物］
（２） 生物の生態と進化
生物の環境への適応について、遺伝の仕組みと自然選択（淘汰）による進化を基に解説する。その上で、集団（個体群）、群集、生態系の構造、存在様式、機能について解説し、生物多様性に関する最新の知見について紹介する。［遺伝システム、進化の仕組み、自然選択、適応、生活史、個体群動態、種間関係、生物群集、食物網、バイオーム、生態系機能、生物多様性］
（３） 動物の行動
時間的空間的に変異する環境における、動物の多様な行動パターンと機能について、適応的な観点から解説する。［適応度、性選択、血縁選択、利他行動、外温動物、防御行動、意思決定］
（４） 人類の特性と進化
ヒトを含む霊長類の生物学的特性を形態、行動、生態を中心に解説し、現生のヒトに至る人類の進化史について最新の知見を紹介する。［分類、分布、樹上適応、把握性、視覚、食性、大脳化、性差、社会構造、直立二足性、犬歯の退縮、道具使用、分娩、現代人の拡散・遺伝的多様性］

スタート時点では高校レベルの生物学の知識は必須ではない。授業中必要になる知識については、授業内で適宜補足する。また、必要に応じて自学自習も求める。

セメスター末に試験を実施して評価する。

予習・復習として生物学の一般的教科書や各専門分野の入門書等を読むことが望ましい。また、授業内容や書籍の内容について、疑問点があれば、担当教員に質問すること。

「細胞と分子の基礎生物学」とともに受講することで、現代の生物学全体を概観できる。

本講義は遺伝学を中心に、分子レベルから個体、集団まで扱う生物学の基礎講義であり、医系学部の生命科学専門科目の履修に向けて必須となる知識の修得を目的とする。高等学校において「生物」を履修しなかった学生も理解できるよう基礎から講義する。

1. DNA複製、転写、翻訳の基本事項を理解する。
2. 遺伝情報がどのようにして子孫に伝えられるのかを理解する。
3. DNA修復、DNA組換えの基本事項を理解する。
3. 遺伝子の変異が種々の疾患を生じ得ることを理解する。
4. 生命科学研究に必要な遺伝子工学の基礎を理解する。
5. 進化、行動遺伝学、集団遺伝学の基本事項を理解する。

1. メンデル遺伝学
2. 遺伝の染色体的基礎
3. 遺伝的連鎖と連鎖地図
4. 遺伝と染色体のふるまい
5. DNAの構造、複製、修復
6. 細菌の遺伝学
7. 遺伝子発現の分子遺伝学
8. 遺伝子調節の分子機構
9. 遺伝子工学、実験遺伝学、オミックス解析
10. 変異とDNA修復
11. 分子進化と集団遺伝学
12. 遺伝子病の分子遺伝学
13. がんの分子遺伝学
14. 複雑形質の遺伝的基礎、行動遺伝学
≪試験≫
15. フィードバック

高等学校レベルの化学の基礎知識があることが望ましい。
前期の『細胞と分子の基礎生物学』の履修が望ましい。

平常点評価（授業参加度、小テストなど２０％）と定期試験（８０％）の総合点により評価する。

配布資料をもとに十分に復習することを期待する。

質問や相談は授業直後や後日に随時受け付けている。後日の場合はまずメールにて連絡すること。
授業中にクイズ等をおこなう。QRコードを読み込むため、スマホ・タブレット・パソコンなどのデバイスを持って来ること。

How do living organisms grow, generate energy, sustain life, and reproduce?

These are the core questions we will explore in this introductory biology course, which focusses on the cellular, chemical, and genetic processes that support life.
Designed to provide a clear and accessible introduction to fundamental biological concepts and how we study them, this course requires no prior knowledge of biology, ensuring students at all levels can comfortably engage with the material.
Students will have the opportunity to explore topics of their own interests through class presentation assignments, such as news or journal articles related to cell biology.

Students are encouraged to continue on to "Introduction to Molecular Cell Biology-E2 (1st semester)" as a follow-up to this course.

Students will gain a foundational understanding of cell structure and function.
Students will acquire an understanding of how basic biological processes influence both simple and complex living organisms.
Students will develop the ability to understand and discuss various aspects of Biology in English.

1. Introduction to Biology
2. Cells & How We Study Them
3. Energy & Metabolism I
4. Energy & Metabolism II
5. Protein Structure and Function
6. Cell Signaling
7. Mid-term exam + Feedback,
Explanation of Class Presentations
8. DNA and Chromosomes
9. Gene Transcription & Translation
10. Reproduction & Cell Cycle
11. Class Presentations
12. Genetic Sequencing & Engineering
13. Gene Mutation & Variation
14. Cancer
≪Final exam≫
15. Feedback

This is an introductory course and prior knowledge of the topic is not necessary. All essential knowledge for the class and exams will be provided in class. Students need only to have a curiosity to learn about the biological processes of life.

Attendance & Participation 25%.
Midterm Exam (Multiple Choice) 25%.
Class Presentation (Short Oral Talk) 25%.
Final Exam (Multiple Choice) 25%.

Review from the textbook, previous lecture content, and preparation for assignments to be presented in class.

The contents of the syllabus are a guide to the content of the course, the exact content may change. Input and suggests from students are very welcome and I am happy to discuss the course material with students via email or in-person meeting.

This class will introduce students to basic but powerful computational tools that are increasingly becoming an essential part of biological research. We will learn how to navigate a command line environment in a UNIX computer system, explore some useful open source software for DNA and protein analysis, and learn the basics of Python programming for analyzing biological sequence and images.

Each class will start with a background lecture and proceed to hands-on guidance. The ultimate aim of the class is to provide an introduction that will facilitate your further exploration of computational biology.

-To discover current bioinformatics and biological image analysis software
-To be able to design analyze DNA sequences using open online software
-To learn general principles of programming using the Python language
-To develop a foundation for further exploration of the exciting world of bioinformatics

1. Overview of the course. How are computers used in biology, and introduction to the "Shell" (terminal)

2. Beginning programming with Python, a general computer language that can be adapted for biology

3. Introduction to manipulating text files and how DNA sequences are stored as text files

4. Extending Python with modules for mathematics (Numpy), biological sequences (Biopython), and data tables (Pandas)

5. The EMBOSS molecular biology suite: Searching protein and DNA sequences for features.

6. Plotting data with Python using the 'plotly' framework

7. Searching and visualizing DNA sequence distribution with
Python

8. Small-group coding exercise #1

9. Protein structure analysis using AlphaFold, ChimeraX, and Python

10. Using Generative AI for programming assistance: strategies, misconceptions, potential

11. Approaching statistics: developing an intuitive understanding of statistical significance. p-values, t tests, Fisher's exact test.

12. Imaging for biologists: Image fundamentals (pixels, intensity, scaling) using Fiji

13. Measuring 2D and 3D objects in images

14. Small-group coding exercise #2

≪Final exam≫

15. Feedback (test review and Q&A session)


Note:Classes on Tuesday, January 5, 2027, will be held in Room 303, Academic Center for Computing and Media Studies (South Bldg.).

A laptop computer with a wireless internet connection is highly recommended for this class.

Windows users should install the program "Cygwin" (from http://www.cygwin.com) to provide a shell environment; Mac and UNIX users can use the built-in terminal program.

All students should also install Python to provide a Python environment.

Provisions can be made for students who do not have their own laptop.

Grading will be based on three areas: active participation, in-class quizzes and exercises, and a final exam.

"Active participation" will be measured by: class attendance, asking questions/giving comments on LMS (as a rule, each student should ask at least 1 question/give one comment on LMS for each class), and answering questions during in-person classes.


The final exam will be a 3-page exam with short answers, multiple choice questions, and a short English writing assignment.

Each area will contribute 1/3rd of the total grade.

Students will have to understand technical vocabulary in English. This may require studying and research outside of class hours.

Office hours will be 1 hour once per week, schedule to be announced on the first day of class.