Biology has become a data rich science. Once lagging behind physicists for many years, biologists are now accumulating large amounts of quantitative data from DNA and protein sequence (genome projects) to large scale analysis of the expression of proteins and metabolites and their interactions. Consequently, numerous databases and resources have emerged to organize, distribute, and make possible the analysis of this huge amount of data.

In this course students will learn about common types of biological data that are rapidly accumulating and the related databases. They will learn to use some powerful online databases and tools that do not necessarily require programming skills. Students will use those tools to analyze DNA and protein sequences, visualize the outcome of large-scale experiments and biological networks, and learn how they can be used to derived knowledge and understanding about the system under study.

By the end of this course participants should be able to:
- Understand and explain some of the common types of quantitative biological data
- Find and analyze DNA or protein sequences using different databases, repositories, and tools
- Exploit linked resources to expand knowledge across data types and resources
- Explore the genome and metabolic network of model organisms
- Analyze data from a model organism of choice to answer particular biological questions
- Gain better understanding of a biological systems through data analysis and interpretation

The following topics and their feedback will be covered over the course of 15 classes, not necessarily in that order:

Week 1 Guidance
Week 2-3 Biochemistry and biomolecules review
Week 4-5 Genomic and proteomic analysis methods and data
Week 6 Introduction to PubMed and sequence databases
Week 7-8 Introduction to sequence analysis using BLAST
Week 9 The UniProt database (features, tools, analysis)
Week 10 The KEGG database (features, tools, analysis)
Week 11-12 The Biocyc and Ecocyc databases (features, tools, analysis)
Week 13 Introduction to biological network analysis
Week 14 Project presentation
Week 16 Feedback

The course is targeted to beginners. A basic familiarity with biomolecules and cell biology is desirable but not essential. Students should bring a computer to class to complete in-class exercises and tutorials as well as homework assignments.

20% Class attendance and participation
60% In-class exercises and homework assignments
20% Project

Out of class activities will mainly be for assigned readings and homework assignments and for working on a project. Students should expect to spend about 1-2 hours per week preparing for the class and completing assignments.

Announced during class.

Academic writing & listening

For the continued development of students' skills in English for General Academic Purposes (EGAP), English Writing-Listening B (EWLB) consists of three components: writing, listening, and vocabulary. EWLB aims to advance the skills in EGAP that students learned in EWLA.

For practice with writing, students analyze and evaluate basic elements of academic writing they learned in EWLA; they further identify, recognize, or understand more advanced elements; finally, they recall and apply all acquired knowledge in the process of producing an academic report of at least 1,000 words. By writing substantial academic reports more autonomously, students will acquire advanced academic writing skills as stated in the Course Goal section below.

For practice with listening, students take the online course known as GORILLA (Global Online Resources for International Language Learning Assistance) outside class. They are assessed on their listening proficiency through weekly online assignments, as well as the four tests that the instructor administers in class.

For vocabulary learning, students use the standard reference book titled “Kyoto University Vocabulary Database 1110.” Like the listening component, students independently study words from the general academic list that the instructor assigns (usually 50 words a week) and are tested on a number of these words weekly.

By the end of this course, students will acquire the following skills at varying levels. Students should be able to:
- Recognize and use basic academic words in English
- Process more advanced academic discourse presented aurally
- Analyze topics and develop suitable controlling ideas, thesis statements, and outlines for academic reports
- Analyze and evaluate the locations, functions, and features of the standard paragraph-level elements of an academic report (i.e., introduction, body, and conclusion paragraphs) and apply the analysis and evaluation when writing academic reports
- Analyze and evaluate the locations, functions, and features of the standard sentence-level elements (e.g., thesis statement, topic sentences, support sentences) and apply the analysis and evaluation when writing academic reports
- Recognize more advanced methods of maintaining the unity (e.g., repetition of key points) and coherence (e.g., quality of language) of ideas in academic reports, evaluate the unity and coherence of their writing, and apply the analysis and evaluation when writing.
- Utilize, with sufficient accuracy, a broad range of citation conventions when formatting academic reports
- Understand more advanced paraphrasing techniques to integrate information from external sources (e.g., summarizing, quoting), recognize and use more detailed citation conventions, and utilize this knowledge to avoid plagiarism
- Evaluate and integrate supporting evidence and sources to produce an academic report.
- Recognize the formatting conventions of an appropriate reference list and apply this knowledge to generate one for an academic report.
- Recognize particular styles and conventions within academic writing and adopt them appropriately
- Acquire a deeper understanding of the writing process in the production of academic reports after revising drafts with feedback
- Combine knowledge of (i) the structure of an academic report, with allowances made for rhetorical style such as argumentation and cause-effect, (ii) the writing process, and (iii) the evaluation and integration of supporting evidence and sources, and apply this knowledge to produce an academic report of at least 1,000 words

In-class activities are related to the contents of the textbook. Though there may be some adjustments in certain cases, the schedule of this course is as follows:

Chapter 1 Paragraph Structure Review
Chapter 2 Academic Essay Structure & Topic Selection
Chapter 3 Thesis Statement & Essay Outline
Chapter 4 Body Paragraphs & Transitional Words
Chapter 5 Paraphrase, Quotation, Summary, & Citation
Chapter 6 Introduction & Conclusion Paragraphs
Chapter 7 Proofreading & Revision
Chapter 8 Quality of Thought: Evaluating Topics
Chapter 9 Quality of Thought: Evaluating Thesis Support
Chapter 10 Quality of Content: Evaluating Evidence
Chapter 11 Quality of Language: Integrating Evidence
Chapter 12 Quality of Language: Academic Style
Chapter 13 Quality of Feedback & Revision
Chapter 14 Overall Quality
Feedback

Important: Some instructors may cover more than one chapter in one week for better learning outcomes in the whole semester. Each instructor decides whether or not the class conducts the final examination in the test week. Students should confirm the class policy from their instructors.

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

1. Vocabulary assessments 10%

2. Listening assessments 20%
*Students must pass at least eight out of 13 learning units (Units 1-12 and TOEFL ITP Sample Test Unit) of the online materials in order to receive credit for this course.
*The score for the listening assessments is determined by performance on four in-class assessments and the study record of the online materials (Units 1-12 and TOEFL ITP Sample Test Unit).

3. Writing assignments 50%
*Scores for writing assignments may include in-class writing tasks and participation in class activities as well as a term paper.
*Students must complete various writing assignments, including an academic report of at least 1,000 words in order to receive credit for this course. Note that plagiarism must be avoided.

4. TOEFL ITP score 20 %
*Students who did not take the TOEFL ITP during the second semester of their first year are strongly encouraged to take a TOEFL ITP hosted by the University Co-op. Failing to do so will result in an automatic 20% deduction from their scores. For more details about the TOEFL ITP test, please visit the University Co-op's website.

英語ライティング−リスニング単位未修得者クラスの全クラスにおいて、原則、正当な理由なく5回以上欠席した場合は、成績評価の対象としません。

Students are required to study academic vocabulary from the designated part (EGAP vocabulary) of the "Kyoto University Vocabulary Database 1110" outside of class, and regularly take vocabulary assessments in class.

Students are also required to study the online listening materials outside of class through the GORILLA system. The materials for this course are as follows:

・KU Academic Listening (B) Units 1-12 (required)
・TOEFL ITP Sample Test Unit (required)
・KU Can-Do Self-Assessment (optional)
・Extra practice for further study (optional)

Students must complete each unit by the assigned deadline. If students miss the deadline for a certain unit, the unit will not be evaluated as a passed unit.
Students must also take four in-class assessments based on the KU Academic Listening (B) units.

For details such as the deadlines and the in-class assessment schedule, please see the handout distributed in class and the information posted on the GORILLA system.

Students are advised to save the textbook PDF file in their digital devices.
If they want a printed version, they can print the file on a printer at home or a nearby shop, purchase a book-binder (less than 200 yen) at the Univ. Co-op shop in the Yoshida-minami Campus or the Clock-tower, and use a binding-machine there for no extra charge.

Students may benefit from accessing the website offered by the Division of English Language Education (DELE), i-ARRC, Kyoto University. The website provides useful information to support students in learning and using English autonomously.
JP:https://www.i-arrc.k.kyoto-u.ac.jp/english_jp
EN:https://www.i-arrc.k.kyoto-u.ac.jp/english

ドイツ語の文法の基礎を学ぶとともに、ドイツ語を話す人々の文化や思考法を知ることを目的とする。

簡単なドイツ語のテキストが、辞書を引きながら読めるようになることを目標とする。

発音から動詞の3基本形まで、以下の文法項目を一通り学ぶ。
1．発音
2．動詞の現在人称変化
3．格と人称代名詞
4．冠詞・名詞の格変化、名詞の複数形
5．不規則動詞の現在人称変化
6．不定冠詞類の格変化、前置詞と格支配
7．定置詞類の格変化、疑問代名詞
8．話法の助動詞、未来形
9．形容詞の格変化、形容詞の名詞的用法
10. 動詞の3基本形と過去人称変化
この講義はフィードバック（方法は別途連絡）を含む全15回で行う。
各項目について２回前後の授業で取り組む予定である。

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

成績評価については，学期末試験（ 50％）・小テスト（20 ％）・平常点（ 30％）に基づくものとする。成績評価基準の詳細については授業中に説明する。

毎回必ず予習・復習をして受講してください。

会話文や読み物を題材にして生きたドイツ語に触れ、さらには文法演習や聞き取り演習などを通して、ドイツ語の基本的な表現の習得をめざす。合わせて、ドイツ語を話す人々の文化や思考法を知ることも目的とする。

文法概念の把握にとどまらない具体的な表現の習得。かんたんな聞き取りを含めた総合的な理解。

発音練習から始め、基本的に教科書にしたがって1〜5課を学ぶ予定。
（1）文字と発音【1〜2回】
（2）第1課【2〜3回】あいさつ／人と知り合う／紹介（名前・出身地・居住地・職業・趣味）
（3）第2課【2〜3回】時刻／時を表す表現／人を誘う／電話番号を尋ねる／食べ物と飲み物／ドイツ紹介
（4）第3課【2〜3回】所持品／家族・親戚
（5）第4課【2〜3回】買い物／値段／プレゼント／メール
（6）第5課【2〜3回】週末の予定／一日の行動／天候
（7）学期末試験
（8）フィードバック【1回】

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

成績評価は、平常の出席・発表等（30％）と、学期末試験（70％）とを総合しておこなう。

毎回の進度に合わせて、しっかりとした復習と予習が必要。詳細は授業を通して指示する。

この授業ではヨーロッパ共通言語参照枠（CEFR）A1.1レベルに相応しい色々なテーマの短い簡単なテキストを用います。コース独自の学習用ホームページもあって、予習復習がきっと楽しくなるはず！

ドイツ語のコミュニケーション能力の養成を中心とした授業を行います。
隣の人とペアを組んで対話をしながら表現を覚え、基本的な文法規則を応用できるようになるのが目標です。

この講義はフィードバック（方法は別途連絡）を含む全15回で行います。
10回以上の出席が必要です。
リスニングと口答練習に重点を置きます。楽しくドイツ語会話を学びましょう。また言語だけではなく、ドイツの生活や文化についてビデオ等を使って紹介します。Momente A1.1 1-6課の授業

第1回　Einfuehrung, HP と Kursbuch・教科書とHP紹介
第2回　L.1 Alphabet・アルファベット
第3回　L.1 W-Fragen, Herkunft・挨拶・人を紹介する
第4回　L.2 Berufe, Familienstand・仕事，婚姻状況
第5回　L.2 Zahlen 1-100, Wohnort・数字100まで，住所
第6回　L.3 Familie, Sprachen・家族，言語
第7回　L.3 Ja/Nein-Fragen, doch・確認の質問
第8回　L.4 Moebel, Zahlen bis 1 Million・家具，数字100万まで
第9回　L.4 Definiter Artikel・定冠詞
第10回　L.5 Farben, Materialien・色の名前，材料
第11回　L.5 Indefiniter Artikel, Negation・不定冠詞，否定
第12回　L.6 Buero, Computer・オフィス，コンピューター
第13回　L.6 Singular, Plural・単数，複数形
第14回　L.6 Akkusativ, Negativartikel・目的格，否定冠詞
　　　　ファイナルテスト
第15回　フィードバック

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

10%・平常点・（出席と参加の状況、受講態度、3分の2以上の出席が必要）
30%・宿題　復習のアクティビティ
30%・ミニテスト
30%・ファイナルテスト:筆記試験

毎回オンライン宿題があります。
ミニテスト

質問があればメールで回答します。deutsch.lernen.in.kyoto@gmail.com
またホームページ https://deutschlerneninkyoto.org 上で授業の進行状況についてのレポートがあります。授業が始まってからアクセス出来ます。
持ち物（教科書、ノート、筆記用具） 教科書を購入しない場合、または授業に持参しない場合は合格できません。

1 フランス語でコミュニケーションをするのに必要な文法の基礎を学ぶ。
2 フランス語の文法学習を通じて多極的世界観を身につける。
(1)フランス語と日本語・英語との相違点に気づく。（複言語学習）
(2)フランス語を話す国民の文化や思考法を知る。（複文化学習）

１）文法を身につけ、フランス語を読んで理解できるようにする。
２）発音と綴り字の関係を学び、フランス語を声にだして読めるようにする。
３）フランス語を話すための基礎力を身につける。

この講義はフィードバック（方法は別途連絡）を含む全１５回で行う。

１　教材は全部で２０課ある。各課は、冒頭の複言語・複文化に関係している「テキスト」と文法事項の説明と練習問題で構成されている。前期は８課までする。
２　授業時間だけでは、フランス語の文法をマスターすることはできない。第２課からは、授業時間外にもネット上でも自律学習する。ひとつの課につき教室外でも６０分から９０分の自律学習をする必要がある。
３ 授業は、CALL教室で教師とともにする学習と教室外でする自律学習のブレンデッド形式で行う。
４　授業開始の２週間を除いて、毎回１課ずつ進み、各課の終了後に小テストを行う。小テストは自己採点し、その結果の自己分析と学習過程に関するポートフォリオも毎回作成する。

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

成績評価は、前期末におこなわれる統一試験、小テストの点とポートフォリオ作成の熱心さに基づいておこなう。つまり、学習結果だけでなく、学習過程も評価の対象にする。詳細については授業で説明する。

授業時間外にもネット上でも自律学習する。ひとつの課につき教室外でも６０分から９０分の自律学習をする必要がある。

1 フランス語でコミュニケーションをするのに必要な文法の基礎を学ぶ。
2 フランス語の文法学習を通じて多極的世界観を身につける。
(1)フランス語と日本語・英語との相違点に気づく。（複言語学習）
(2)フランス語を話す国民の文化や思考法を知る。（複文化学習）

１）文法を身につけ、フランス語を読んで理解できるようにする。
２）発音と綴り字の関係を学び、フランス語を声にだして読めるようにする。
３）フランス語を話すための基礎力を身につける。

この講義はフィードバック（方法は別途連絡）を含む全１５回で行う。

１　教材は全部で２０課ある。各課は、冒頭の複言語・複文化に関係している「テキスト」と文法事項の説明と練習問題で構成されている。前期は８課までする。
２　授業時間だけでは、フランス語の文法をマスターすることはできない。第２課からは、授業時間外にもネット上でも自律学習する。ひとつの課につき教室外でも６０分から９０分の自律学習をする必要がある。
３ 授業は、CALL教室で教師とともにする学習と教室外でする自律学習のブレンデッド形式で行う。
４　授業開始の２週間を除いて、毎回１課ずつ進み、各課の終了後に小テストを行う。小テストは自己採点し、その結果の自己分析と学習過程に関するポートフォリオも毎回作成する。

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

成績評価は、前期末におこなわれる統一試験、小テストの点とポートフォリオ作成の熱心さに基づいておこなう。つまり、学習結果だけでなく、学習過程も評価の対象にする。詳細については授業で説明する。

授業時間外にもネット上でも自律学習する。ひとつの課につき教室外でも６０分から９０分の自律学習をする必要がある。

フランス語によるコミュニケーションの基礎を学ぶとともに、フランス語を話す国民の文化や思考法を知ることを目的とする。簡単な日常会話ができる程度の運用能力の養成を到達目標とする。

フランス語での簡単な日常会話ができ、状況に応じて自分の希望や意見を述べ、また日常的なフランス語の文章を読み、簡単なフランス語の文章を自分で書くことができることを目指す。複数文化を知り、その違いを認識できるようにすること。

次のテーマについて授業を行なう。 以下のようなテーマに沿って授業を行う。各テーマに1-3回の授業を割く。


１．自己紹介。
自己紹介、挨拶。相手に名前を尋ねる。誰かを紹介する。男性形と女性形。動詞の活用。VouvoiementとTutoiementの違い。アルファべ
２．紹介。挨拶。
国籍／職業と職場を尋ねる。話しかけ、簡単な質問をする。êtreとaller動詞の活用。リエゾンとアンシェヌマン
３．連絡先を交換する。
数字。Avoir動詞の活用。
４．趣味。好きなもの
好みや趣味を言う。意見を言う。食べ物と飲み物。スポーツ（aimer, adorer, préférer, vouloir）。
仮定法で活用したAimerとVouloirを使った意思の表現。parce queを使って理由を述べる
５．人を描写する　　形容詞の男性形／女性形。
６．数字。時間。科目。曜日
疑問形容詞quel


※授業計画はその進み具合などによって変更する可能性がある。

授業日が14回（小テスト含む）、試験日が1回、フィードバックが1回行われる。

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

期末試験(３０％)以外に、授業中に小テスト（２０％）と期間中テスト（３０％）を行なうとともに授業への参加度（２０％）によって評価する。遅刻や欠席が多ければ、単位は認定されない。

外国語の学習では、授業で習ったことを自宅に帰ってから＜身につける＞作業が不可欠なので、単語の記憶や動詞活用の練習など、毎回復習をしっかり行うこと。

実習の授業なので毎回の出席と授業への積極的な参加が求められる。

フランス語に慣れ親しんでもらう。反復的な会話の練習などにより、まずは、フランス語の言葉や文章を書くことを経験として体得していく。会話を中心に、文法や文章構造などを学んでいく。また、フランス語を通してフランス文化を学ぶ。フランスとフランス文化に対する関心を強める。

基礎的な日常会話を身につける。かんたんな意思の疎通ができ、その会話の内容と同等レベルの文章の読み書きができるようになる。フランス文化について知識を深めると同時に、自分のことについても、かんたんな説明ができるようになる。

初級レベルのフランス語の教材を用いて、日常会話を中心にフランス語を学ぶ。
以下のようなテーマに沿って授業を行う。各テーマに2-3回の授業を割く。

１．オリエンテーションおよび自己紹介。
自己紹介、挨拶。相手に名前を尋ねる。誰かを紹介する。男性形と女性形。動詞の活用。VouvoiementとTutoiementの違い。
２．紹介。
国籍／職業を尋ねる。話しかけ、簡単な質問をする。形容詞の男性形／女性形。Être動詞の活用。
３．連絡先を交換する。
数字。大文字／小文字の使い方。Avoir動詞の活用。
４．趣味。
好みや趣味を言う。意見を言う。同意や反対の意思を伝える。-er動詞の活用（aimer, adorer）。
５．レジャー。
習慣を伝える。提案をする。誘いを受ける／断る。定冠詞leと指示代名詞ce。仮定法で活用したAimerとVouloirを使った意思の表現。
６．希望／願い。
所有を語る。希望を伝える。「もの」に対する意見を述べる。原因を尋ねる。非定冠詞と所有の表現。


授業日が14回（小テスト含む）、必要に応じて試験日が1回、フィードバックが1回行われる。

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

期間中に小テストを行なう（平常点評価）。この授業中に行なう小テストが基本的な評価対象となる。授業の進行状況に応じて、学期末にテストを行う（授業内のテストで足りないと判断した場合、学期末のテストを行う）。
また、授業への参加度も評価する。遅刻や欠席が多ければ、単位は認定されない。

言語の習得には予習・復習が欠かせません。

授業中に、あるいはPandAなどを通す形で予習すべき範囲や、宿題・課題を提示します。ただし、受動的に学ぶのではなく、授業で学んだことを、学生が自主的に勉強することが必要となります。

本授業は、初めて中国語を学ぶ学生を対象にしたものであり、簡単なスキットと初歩的な文法事項を段階的に学びながら、読む、書く、聞く、話すといった能力を身につけてゆく。この授業では特に文法的知識の習得を目指し、演習の授業と連携したかたちで、授業をすすめる。

中国語の発音体系を身につけた上で、中国語の基礎的な文法事項を理解し、中国語による表現の基礎を身につける。北京などを舞台としたスキットを題材としつつ、広く中国の文化に対する理解を深める。

この講義はフィードバック（方法は別途連絡する）を含む全15回で行う。
最初の３回の授業では、テキストの「発音編」に基づきながら、中国語の表音システムであるピンイン（ローマ字綴り）の学習を通じて中国語の発音体系のあらましを習得する。
その後、テキストの「本文編」に基づきながら、スキットと文法事項ごとの例文の学習を通して、正確な文法的知識、基本的な表現力の習得を目指す。前期は発音編と本文編第九課までを学びながら、特に、文法体系の枠組みを理解することをめざす。原則として1回の授業で本文編の１課分を学習する。なお、Web上にも教材の音声を置き、履修生には24時間自由なアクセスを認め、その自学自習を支援する。
本授業は、所定の演習の授業と連携して行われるため、かならずセットで履修しなければならず、この授業だけの履修は原則として認められない。各回において学ぶ内容（発音事項・文法事項）は次のようである。

第1回　発音編「中国語の音節構造」「声調」「韻母 その一 単母音」「声母 その一」
第2回　発音編「韻母 その二 複合母音」「声母 その二」「韻母 その三 鼻音を伴う母音」「第3声の発音」
第3回　発音編「簡単なフレーズ」「声調変化」「軽声」「儿化」
第4回　第一課、「人称代詞」「動詞述語文」
第5回　第二課、「連体修飾1“名詞／代名詞＋的＋名詞”」「判断詞“是”“不是”」「副詞“都”“也”」
第6回　第三課、「形容詞述語文」「指示代詞」「動詞“在”」」
第7回　第四課、「疑問代詞“shen me”」「助動詞“想”など」「副詞“就職”」「動詞 “有”」「方位詞」
第8回　第五課、「連動文」「時間詞1“今天”など」「文末の語気助詞“ma”“ba”“ne”」「連体修飾2“形容詞＋的＋名詞”」
第9回　第六課、「選択疑問文」「比較表現」「疑問代詞“weishenme”“zenme”」
第10回　第七課、「連体修飾3“動詞句＋的＋名詞”」「進行表現」「“喜歓”＋動詞／名詞」
第11回　第八課（前半）、「主述構造を目的語とする動詞」「“対…感興趣”」
第12回　第八課（後半）、「副詞“一直”」「二重目的語」
第13回　第九課（前半）、「時間詞2　年・月・日・曜日・時刻」「さまざまな“了”」
第14回　第九課（後半）、「アスペクト助詞“過”」 「動詞＋“一下”」
《期末テスト》
第15回　フィードバック

「全学共通科目履修の手引き」を参照してください。

原則として定期試験80％、平常点20％で評価する。詳細については授業の最初の時間に説明する。
基本的な語彙・文法事項の理解と、それを用いた表現能力の修得が評価の対象となる。

Web上に教材や練習問題の音声を置く。24時間自由にアクセスできるので、必ず授業の前に、音声を聞くとともに文法事項について目を通しておくこと。また、練習問題が宿題となることもある。必ず復習とともに練習問題等の課題を行うこと。

最初の授業において紹介する。